Virome of gastrointestinal tract:of pigs and wild boars: Identification and analysis of virus agentssamostatný vedecký pracovník
Basic information
Slovak title:
Viróm gastrointestinálneho traktu ošípaných a diviakov: Identifikácia a analýza vírusových agensov.
Registration No.:
APVV-15-0415
Source:
Slovak research and development agency
Implementation time:
2016 - 2020
Principal (UVMP):
Vilček Štefan, prof. Ing., DrSc. (2016: 100% | 2017: 100% | 2018: 100% | 2019: 100% | 2020: 100%)
Principal workplace:
Department of Epizootiology, Parasitology and Protection of One Health
Principal workplace:
Department of Epizootiology, Parasitology and Protection of One Health
Contributors:
Pistl Juraj, prof. MVDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Jacková Anna, doc. MVDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Csank Tomáš, doc. MVDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Mandelík René, MVDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Novotný Jaroslav, doc. MVDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Molnár Ladislav, doc. MVDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Šalamúnová Slavomíra, RNDr., PhD. (2016: % | 2017: % | 2018: % | 2019: % | 2020: %)
Field of study:
190 - Agricultural and forestry sciences
Financial indicators
NON-CAPITAL FUNDING in €
CAPITAL FUNDING in €
Allocated
Spent
Allocated
Spent
Allocated / Spent
Allocated / Spent
2016
24100
24100
0
0
24100 / 24100
0 / 0
2017
61300
61300
0
0
61300 / 61300
0 / 0
2018
76000
76000
0
0
76000 / 76000
0 / 0
2019
68300
68300
0
0
68300 / 68300
0 / 0
2020
0
0
0
0
0 / 0
0 / 0
Spolu
229700
229700
0
0
229700 / 229700
0 / 0
Anotation
Tento projekt je zameraný na identifikáciu a analýzu vírusov infikujúcich gastrointestinálný trakt hnačkujúcich a zdravých ošípaných a diviakov. Pozornosť bude venovaná nie len známym a nebezpečným vírusom , ako je TGEV, PEDV, rotavírusy so silným socio-ekonomickým impaktom, ale aj novým vynárajúcim sa vírusom ako je napr. hokovírus, kobuvírus, sapovírusy a iné. Do komplexnej analýzy virómu enterálnych vzoriek budú zaradené aj najnovšie metódy ako NGS s potenciálom objavu nových doteraz neznámych vírusov. Okrem identifikácie genómy vírusových agensov budú študované z pohľadu odkrývania ich unikátnych vlastnosti ako sú inzercie, delecie, mutácie, ako aj evolúcie na molekulovej úrovni a s výužitím v molekulovej epizootológii. Vírusy so zoonotickým potenciálom (napr. vírus hepatitídy E) budú študované u ošípaných a u inkriminovanej časti ľudskej populácie.
This project is focused on the identification and analysis of viruses infecting gastrointestinal tract of diarrheic and healthy pigs and wild boars. Research will be oriented on highly dangerous viruses as TGEV, PEDV, rotaviruses with high socio-economical impact as well as on new emerging viruses as for example hokovirus, kobuvirus, sapoviruses and others. The complex analysis of virome in enteric samples will be carried out using new method as NGS with potential of discovery of new viruses. The genomes of identified viruses will be studied using bioinformatic tools to reveal unique motifs as insertions, deletions, mutations. The study will also cover evolution of viruses at the molecular level and application in molecular epidemiology. Viruses with zoonotic character (virus of hepatitis E) will be studied in pigs and in incriminated part of human population.
Publication outputs